通义灵码在IDEA中点击登录按钮后，如果在弹出页面已经成功登录，但IDEA界面仍显示未登录，可能是由以下几个原因导致的：
会话同步问题：有时，尽管在弹出页面登录成功，但由于会话信息没有正确同步回IDEA，导致IDEA界面仍显示未登录。这可能是由于网络延迟、IDEA插件的bug或配置问题导致的。
插件冲突或版本不兼容：通义灵码插件可能与IDEA中的其他插件存在冲突，或者与当前IDEA版本不兼容，导致登录状态无法正确显示。
配置文件或环境变量问题：通义灵码的安装和配置过程中，如果配置文件存在错误或缺失，或者系统环境变量没有正确设置，也可能导致登录状态显示异常。
针对这些问题，您可以尝试以下解决方案：
重启IDEA：首先，尝试完全关闭IDEA并重新启动，看看是否能解决会话同步问题。
检查插件兼容性：确保您安装的通义灵码插件与当前IDEA版本兼容。您可以在插件市场或官方文档中查找支持的IDEA版本信息。
禁用其他插件：尝试禁用IDEA中的其他插件，特别是那些可能与通义灵码存在冲突的插件，然后重新尝试登录。
检查配置文件和环境变量：检查通义灵码的配置文件是否正确，并确保系统环境变量（如JAVA_HOME和PATH）已经正确设置。
查看日志文件：查看IDEA和通义灵码的日志文件，通常位于IDEA的日志目录下。这些日志文件可能会提供关于登录问题的更多详细信息，帮助您进一步定位问题。
联系技术支持：如果以上方法都无法解决问题，建议您联系通义灵码的技术支持团队，向他们详细描述您遇到的问题，并提供相关的日志信息和配置细节。他们将能够更具体地帮助您解决问题。
请注意，由于软件更新和版本变化，上述解决方案可能需要根据实际情况进行调整。始终确保您使用的是最新版本的IDEA和通义灵码插件，并遵循官方文档和指南进行配置和使用。